В 1941 году Стефан Романович Сушков был призван в ряды Советской армии, осенью 1941 года в составе 848  артполка 283-й стрелковой дивизии, ему пришлось с тяжелыми боями отступать, прорываться из окружения. Но при всех обстоятельствах Стефан Романович проявлял мужество и стойкость. Под Ефремовым в начале декабря 1941 года, дивизия, где сражался Сушков, перешла в наступление.

После чего 848-й артполк был преобразован в 9-ой гвардейский. 5 августа 1943 года гвардейцы освободили Орел, а в ноябре  1943 года город Гомель. Летом 1944 года за успешное форсирование водной преграды (реки Друть) и проявленное мужество командир орудия 5-ой батарей Стефан Романович Сушков был награжден орденом Отечественной войны I степени. К тому времени он был награжден медалями «За отвагу» и «За боевые заслуги», дважды ранен и контужен.

На заключительном этапе войны гвардии старший сержант Сушков участвовал в разгроме Восточно-Прусской и Берлинской группировок врага и закончил свой боевой путь 8 мая 1945 года западнее поверженного Берлина.